宜宾市中医医院临床学科门类齐全，建有3个国家级名医工作室（国医大师张大宁、岐黄学者杨明、云南姚氏妇科）和6个省级名医工作室；医院现开设有针灸科、康复科、治未病科等31个临床科室和10个医技科室，建成市级重点中医专科9个(针灸科、肛肠科、耳鼻喉科、肾病科、骨伤科、内分泌科、心病科、脾胃病科、泌尿外科)，在建市级重点中医专科6个(脑病科、肺病科、普外科、肿瘤科、重症医学科、治未病科)、临床重点专科1个(重症医学科)，培育省级重点中医专科4个；建有二级生物安全实验室，配备有GE1.5T高场核磁共振（MRI )、飞利浦FD20数字减影血管造影X线机（ DSA )、GE128排256层能谱 CT 、奥林巴斯290胃肠镜、康复训练机器人等先进仪器设备。